Polacy stworzyli oprogramowanie wykrywające warianty strukturalne lepiej niż dotychczasowe metody. ConsensuSV
Polacy stworzyli oprogramowanie wykrywające warianty strukturalne lepiej niż dotychczasowe metody. ConsensuSV
Wykrywanie wariantów strukturalnych (SV) za pomocą sekwencjonowania ludzkiego DNA nie jest łatwym zadaniem. Zaproponowano wiele podejść; jednak wszystkie metody mają swoje ograniczenia. Stosując meta-podejście oparte na konsensusie, osiem niezależnych procesów identyfikacji wariantów strukturalnych używanych jest do generacji wyniku o wysokiej trafności. Oprogramowanie stworzone przez naukowców z Politechniki Warszawskiej wykorzystuje surowe dane z sekwencjonowania i automatycznie wykonuje wszystkie niezbędne kroki, znacznie skracając czas potrzebny badaczom na przetwarzanie danych. Pliki wyjściowe zawierają warianty strukturalne (SV), polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNP) i Polimorfizmy insercyjno-delecyjne (indele)
Źródło: https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btac709/6782956 i https://twitter.com/PW_edu/status/1589978622080974848