Genomicy z Google Health współpracują z PaCbio - DeepConsensus

Genomicy z Google Health współpracują ze specjalistami od sekwencjonowania PaCbio, tworząc DeepConsensus - algorytm, który znacząco zwiększa ilość odczytów sekwencjonowania dobrej jakości.

Znaczny wzrost dokładności (wersja 1.0 zwiększa wydajność odczytów HiFi Q30 w zestawie danych testowych o +76% w porównaniu z +49% w wersji 0.3). Szybszy czas pracy (~10%) dzięki zastosowaniu destylacji modelowej.

Wspomniany odczyt Q30 to wskaźnik jakości określający ryzyko nieprawidłowego odczytania pary zasad jako 1 na 1,000.

Więcej o DeepConsensus w pracy: https://www.nature.com/articles/s41587-022-01435-7.epdf

Phred Quality Scores dla NGS (Wikipedia):